研究报告

西瓜ζ-胡萝卜素脱氢酶基因ZDS的克隆和序列分析  

吴川1,2 , 崔浩楠1,2 , 丁卓1,2 , 高鹏1,2 , 栾非时1,2*
1东北农业大学,农业农村部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,哈尔滨, 150030; 2东北农业大学园艺园林学院,哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2019年12月30日    接受日期: 2020年01月03日    发表日期: 2021年04月06日
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摘要

西瓜果实因富含类胡萝卜素而具有一系列瓤色。为研究西瓜果实中类胡萝卜素合成过程,利用西瓜参考基因组数据,从红色西瓜材料 LSW-177中克隆了一个ζ- 胡萝卜素脱氢酶基因(ZDS)cDNA全长,命名为ClZDS,该基因编码区为 1 731 bp,编码 576个氨基酸。亚细胞定位预测显示,ClZDS蛋白可能被定位在叶绿体中;保守结构域和多重序列比对分析显示,西瓜 ClZDS蛋白含有高等植物ζ- 胡萝卜素脱氢酶特有的 NAD结合结构域以及类胡萝卜素结合结构域;系统进化树分析表明 ClZDS与同属葫芦科的甜瓜和西葫芦的 ZDS蛋白亲缘关系最近,物种间分化程度较小;荧光定量 PCR结果显示ClZDS 基因在西瓜果实授粉后40 d表达量最高。这些结果为进一步研究ClZDS 基因在西瓜果实的类胡萝卜素合成途径中的作用提供了依据。

关键词
西瓜;类胡萝卜素;ZDS;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
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